ويزخر قسم المراجع في المكتبة بخمسة عشر ألف كتاب من الكتب المرجعية بما فيها المجموعات الفلسطينية الخاصة، كالمعاجم، والموسوعات، وكتب التراجم، وكتب تعداد السكان والمساكن، وغيرها. ويمكن الإفادة من هذه الكتب في القسم فقط وليست من المسموح إعارتها. ولتمييز المراجع عن غيرها تم إدراج الحرف «م» بجانب رقم التصنيف للكتب العربية، والحرف «R» للكتب الأجنبية.
إن خدمة المراجع أو المعلومات هي عملية مساعدة يقدمها موظفو المكتبة للمستفيدين الذين يسعون الى المعلومات، سواء أكانت هذه المساعدة مجرد توجيه المستفيد الى الرفوف ام بحثا يضم موارد كثيرة او يتطلب وقتا طويلا نسبيا.
ويعتبر القسم أيضا رافدا مهما للطلبة الجامعيين لإيجاد موضوعاتهم الدراسية وابحاثهم الجامعية ويؤم هذا القسم عدد كبير من الطلبة، ويتم تزويد هذا القسم بالدراسات والابحاث والكتب القيمة بشكل دائم ومستمر.
وتشمل الخدمات المرجعية:
- الاجابة على الاسئلة المرجعية التي يتقدم بها القراء والمستفيدون بشكل مباشر.
- ارشاد الرواد وتوجيههم الى الأماكن والمراجع التي يحتاجونها في المكتبة.
- تعليم وتدريب المستفيدين على استخدام المراجع المختلفة.
- ترتيب المراجع على ارفف واعادة المراجع الى اماكنها الصحيحة.
- تقديم خدمات الدعم للباحثين وخدمات التصوير.